Dalam merealisasikan visi, misi dan programnya, PSQ berpegang teguh pada sejumlah nilai dasar yang menjadi pedoman dalam menjabarkan visi, misi dan tujuan institusi. Nilai-nilai tersebut adalah:
- Tauhid, bahwa inti dari segala program PSQ bertumpu pada asas tauhid, yakni untuk menyatakan komitmen terhadap keesaan Allah Swt, Tuhan semesta alam.
- Kemanusiaan, bahwa setiap orang harus dihargai pendapatnya sebagai manusia dan setiap manusia berpotensi melahirkan pendapat yang patut dihargai.
- Ukhuwah, bahwa perbedaan suku bangsa, bahasa, aliran, madzhab dan agama bukanlah penghalang untuk menciptakan kebersamaan.